Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SctQ08535 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SctQ08535 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SctQ08535 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SctQ08535 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SctQ08535 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SctQ08535 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SctQ08535 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SctQ08535 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SctQ08535 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SctQ08535 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SctQ08535 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SctQ08535 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SctQ08535 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SctQ08535 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SctQ08535 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SctQ08535 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SctQ08535 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SctQ08535 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SctQ08535 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms