Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gata4Q08369 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gata4Q08369 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms