Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NrepQ07475 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms