Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdx4Q07424 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cdx4Q07424 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms