Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cntn3Q07409 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms