Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nfe2Q07279 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms