Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sh3bp2Q06649 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms