Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Prrx2Q06348 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrx2Q06348 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms