Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cab39Q06138 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cab39Q06138 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms