Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PtprgQ05909 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PtprgQ05909 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms