Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col9a1Q05722 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col9a1Q05722 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms