Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a1Q04857 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a1Q04857 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms