Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Top1Q04750 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms