Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Emx1Q04742 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Emx1Q04742 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms