Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smpd1Q04519 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smpd1Q04519 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms