Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RelaQ04207 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RelaQ04207 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms