Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Kcnb1Q03717 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Kcnb1Q03717 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms