Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Scg2Q03517 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms