Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddr1Q03146 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms