Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col6a2Q02788 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms