Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NfiaQ02780 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms