Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gjb5Q02739 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms