Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ctnnb1Q02248 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnnb1Q02248 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms