Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkcqQ02111 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms