Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mc1rQ01727 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms