Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HmgcrQ01237 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HmgcrQ01237 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms