Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SelpQ01102 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SelpQ01102 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms