Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Grin2bQ01097 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Grin2bQ01097 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms