Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F8a1Q00558 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms