Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gabpb1Q00420 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms