Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pax8Q00288 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms