Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cry1P97784 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cry1P97784 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms