Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
rp9P97762 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
rp9P97762 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
rp9P97762 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
rp9P97762 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
rp9P97762 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
rp9P97762 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
rp9P97762 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
rp9P97762 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
rp9P97762 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
rp9P97762 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
rp9P97762 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
rp9P97762 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
rp9P97762 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
rp9P97762 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
rp9P97762 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
rp9P97762 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms