Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Polr2cP97760 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2cP97760 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2cP97760 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2cP97760 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Polr2cP97760 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Polr2cP97760 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms