Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gata5P97489 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata5P97489 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms