Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lig3P97386 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig3P97386 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lig3P97386 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lig3P97386 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms