Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Msx3P70354 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Msx3P70354 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms