Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tgif1P70284 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tgif1P70284 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms