Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rad54lP70270 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms