Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chl1P70232 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chl1P70232 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms