Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrig1P70193 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms