Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Crip1P63254 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms