Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SnrpnP63163 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpnP63163 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms