Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx1P63006 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx1P63006 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms