Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr2lP62876 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr2lP62876 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr2lP62876 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr2lP62876 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr2lP62876 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr2lP62876 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Polr2lP62876 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms