Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snrpd1P62315 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms