Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps13P62301 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps13P62301 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps13P62301 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms