Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms