Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smg6P61406 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smg6P61406 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smg6P61406 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg6P61406 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smg6P61406 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms