Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl27P61358 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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